В фондах ГБУК РТ «Иске-Казанского государственного историко-культурного и природного музея заповедника» имеются предметы музейного значения, полученные в результате археологических исследований объектов археологического наследия федерального значения Камаевского городища и Русско-Урматского селища XIII-XV вв. Основная часть музейной коллекции музея, состоящая из археологических экспонатов, была собрана и сформирована в 1970-80-е годы группой ученых Института языка литературы и истории им. Г. Ибрагимова КФАН СССР под руководством доктора исторических наук Р.Г.Фахрутдинова. Археологическая экспозиция посвящена истории Иске Казани. Ее фонд составляет 391 предмет. В 2005 г. достроено новое двухэтажное здание музея с фондохранением, где созданы новые археологическая и этнографические экспозиции. На всем протяжении существования музея приоритет в пополнении фондового собрания отдавался вещественным памятникам этнографии и истории татарского народа. Этнографическая коллекция 794 предмета, посвящена материальной и духовной жизни татар Заказанья кон. XIX— нач. XXвв. Наряду с комплектованием этнографической коллекции музей пополняет свои фонды книгами, их количество составляет 173 предмета. Сотрудники музея хотели обозначить богатую книжную культуру нашего народа. История, культура татарского народа, несмотря на все исторические перипетии, сохранилась только благодаря книжной культуре. В экспозиции показана связь поколений – культуру татарского народа, в первую очередь, сохранили и донесли до наших дней ученые, после ученых – религиозные деятели. Сегодня в коллекции «Книги» уже имеются такие редкие экземпляры как рукописные книги разных периодов, учебники по арабскому языку, таджвиду, биологии и другим наукам на татарском языке арабской графикой, коран, свидетельство о сдаче экзаменов шакирда медресе и др. В музее имеется фонд «Нумизматика». Сегодня их количество составляет 1527 единиц хранения. В 2001 году любитель — коллекционер г. Казани Маслов В.П., побывав в музее, подарил музею свою коллекцию значков советского периода. Тематика их обширна. Также в фонде имеются российские монеты и деньги советского периода.